PathoKey SQ FLEX Pathogen ID Assay
KompleksMikrobiyom Örneklerinden Patojenlerin Kalitatif Tespiti
PathoKey SQ FLEX Pathogen ID Assay(4x24),bağırsak mikrobiyomu, kontamine gıda ve klinik numuneler gibi kaynaklardan bakteri, mantar, ökaryotik topluluklar ve virüslerin kapsamlı ve güvenilir bir şekilde profillenmesini sağlayan yeni nesil dizileme tabanlı bir testtir.
Bakteriyel 16S hiperdeğişken bölgelerinin (V1-V2 ve V3-V5) ve rpoB bölgelerinin, fungalhiperdeğişken bölgelerin (ITS1 ve ITS2) ve 28S bölgesinin (D2) ve ökaryotik 18S hiperdeğişken bölgelerinin(V3 ve V8-V9)ve 28S bölgesinin (D2)herhangi bir kombinasyonunu sorgulama esnekliğine sahiptir Ek olarak, bu test 10'a kadar virüsü ve 32 AMR genini tespit eder.Testin 103 – 104 CFU/mL veya kopya/mL'lik bir Saptama Sınırı (LoD) vardır ve tam kan, plazma, serum, nazofaringealswablar, tükürük, idrar, dışkı, FFPE, CSF, BAL ve cilt sürüntüleri gibi klinik örneklerle çalıştığı gösterilmiştir.Ek olarak, iş akışı çalışmasını izlemek için harici bir pozitif kontrol, iş akışı kontaminasyonunu saptamak için bir negatif kontrol ve ekstraksiyon işleminin geçerliliğini doğrulamak için bir ekstraksiyon kontrolü bulunur.
PathoKey® Assay iş akışı, nükleik asit ekstraksiyonu, PCR kurulumu ve 24 adede kadar numune için NGS kütüphane hazırlığı için otomatik bir robotik otomasyon sistemi (Sentosa® SX 101) kullanır. Şablon Kütüphane hazırlama, Sentosa® ST401 sistemi üzerinde Ion PGM Hi-Q View OT2 Kiti kullanılarak emülsiyon PCR üzerinden yapılır ve IonTorrent NGS platformunda dizilenir. Veri yorumlama daha sonra Sentosa® SQ Reporter yazılımı tarafından gerçekleştirilir ve her numunede tespit edilen patojenlerin listesini içeren bir rapor oluşturulur. Bu, yüksek verim sağlarken uygulamalı zamanı ve insan hatasını en aza indirir.
Eşsiz Çok Yönlülük
Seçilebilecek 5 panel: bakteri, mantar, parazit, virüs ve genotipikantimikrobiyal direnç (AMR)
Amplikon dizilimi, tek seferde 4 gruba kadar tanımlamaya izin verir
Kapsamlı Tespit
Tespit edilen tüm patojenleri > 500.000 bilinen diziden oluşan bir veri tabanıyla karşılaştırır Göreceli bolluklar rapor edilir, bu da kommensallerin veya çevresel kontaminasyonunpatojenik mikroplara karşı farklılaşmasına izin verir
Laboratuvar Verimliliğini En Üst Düzeye Çıkarma
Örnekleri kültürlemek için uzun süreler harcamanıza gerek yok 2 saatten daha kısa süreli uygulama, 2 gün içinde örnekten sonuca Sentosa SQ Reporter ile otomatik veri analizi ve rapor oluşturma ile benimsenmesi kolay, yüksek düzeyde otomatikleştirilmiş NGS iş akışı
BİZİMLE İLETİŞİME GEÇİN
